Le CCE est une instance démocratique dirigée par des représentants syndicaux, élus par les cheminots. Aujourd'hui, 26 comités d'établissement (23 CER et 3 CE) correspondant aux régions SNCF et à ses directions centrales sont en place. Ils ont en charge des activités de proximité, à caractère local, liées au territoire sur lesquels ils sont implantés.
Ils confient au CCE la gestion des activités à caractère national, suivant un mandat de gestion entre les organisations syndicales représentatives, renouvelable tous les 5 ans.
Le CCE est dirigé par 40 cheminots élus, issus des comités d'établissement. Ils désignent un bureau de 10 membres composé d'un secrétaire, d'un trésorier, de secrétaires adjoints et d'un trésorier adjoint. Le bureau est aidé dans son travail par 10 commissions. Les élus du CCE nomment un directeur chargé de gérer l'ensemble du personnel et des services.
   
Les élus
   
 

Commissions :
• Économique
• Conditions de travail
et santé
• Formation professionnelle et emploi
• Logement
• Égalité professionnelle
• Encadrement
• Retraités
• Budgets
• Information/Communication
• Activités sociales, sportives et culturelles


Sous-commissions :
• Vacances adultes
• Vacances jeunes
• Activités lecture et bibliothèques
• Activités et relations avec les sociétés d'agents